Το Τμήμα Γεωπονίας χωρίζεται σε τρεις τομείς, τον Τομέα Αξιοποίησης Φυσικών Πόρων, τον Τομέα Φυτοπροστασίας και Βιοτεχνολογικών Εφαρμογών και τον Τομέα Οπωροκηπευτικών και Αρχιτεκτονικής Τοπίου.

ΤΟΜΕΑΣ Αξιοποίησης Φυσικών Πόρων
Διευθυντής Τομέα: Τζανακάκης Βασίλειος, Αναπληρωτής Καθηγητής

ΤΟΜΕΑΣ Φυτοπροστασία και Βιοτεχνολογικών Εφαρμογών
Διευθυντής Τομέα: Πασχαλίδης Κωσταντίνος, Καθηγητής

ΤΟΜΕΑΣ Οπωροκηπευτικών και Αρχιτεκτονικής Τοπίου
Διευθυντής Τομέα: Καμπουράκης Εμμανουήλ, Αναπληρωτής Καθηγητής